Bitka za Zemlju je završena, ali je bitka za prevlast u univerzumu tek započela. Po povratku na Sajbertron, Starskrim preuzima komandu nad Deceptikonima i odlučuje da se vrati na Zemlju svom snagom. Autoboti koji veruju da je mir moguć otkriće da je Skorpioniks ukrao Megatronovo mrtvo telo iz vojne baze i da ga je oživeo koristeći svoju sopstvenu iskru. Sada se Megatron vraća u potrazi za osvetom uz podršku Starskrima i Deceptikona. Zato će Autoboti, sa svojom pomoći na putu, morati da se suoče sa nečim mnogo većim od onoga što može da se vidi golim okom.